Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx4Q9QY61 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx4Q9QY61 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx4Q9QY61 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx4Q9QY61 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms