Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snai3Q9QY31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snai3Q9QY31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms