Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn4Q9QXZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn4Q9QXZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn4Q9QXZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn4Q9QXZ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn4Q9QXZ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms