Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PdcQ9QW08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdcQ9QW08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdcQ9QW08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PdcQ9QW08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdcQ9QW08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms