Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00474Q9P2X8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00474Q9P2X8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00474Q9P2X8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00474Q9P2X8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms