Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD7Q9P2D1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD7Q9P2D1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD7Q9P2D1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHD7Q9P2D1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD7Q9P2D1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms