Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABI3Q9P2A4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABI3Q9P2A4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABI3Q9P2A4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms