Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC88CQ9P219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC88CQ9P219 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC88CQ9P219 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms