Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL20A1Q9P218 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL20A1Q9P218 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL20A1Q9P218 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL20A1Q9P218 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms