Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms