Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAMSAP3Q9P1Y5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMSAP3Q9P1Y5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMSAP3Q9P1Y5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms