Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMCD1Q9NZU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMCD1Q9NZU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMCD1Q9NZU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms