Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf78Q9NZ63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
C9orf78Q9NZ63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
C9orf78Q9NZ63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf78Q9NZ63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf78Q9NZ63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
C9orf78Q9NZ63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
C9orf78Q9NZ63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
C9orf78Q9NZ63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
C9orf78Q9NZ63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C9orf78Q9NZ63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
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