Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNK4Q9NYG8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNK4Q9NYG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNK4Q9NYG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms