Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CNTLNQ9NXG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CNTLNQ9NXG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CNTLNQ9NXG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CNTLNQ9NXG0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CNTLNQ9NXG0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CNTLNQ9NXG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CNTLNQ9NXG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CNTLNQ9NXG0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CNTLNQ9NXG0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CNTLNQ9NXG0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CNTLNQ9NXG0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms