Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB20Q9NX57 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB20Q9NX57 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAB20Q9NX57 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB20Q9NX57 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB20Q9NX57 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms