Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM30AQ9NV96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM30AQ9NV96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM30AQ9NV96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1020.5 ms