Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF19AQ9NV58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF19AQ9NV58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF19AQ9NV58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF19AQ9NV58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms