Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCF3Q9NUQ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF3Q9NUQ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms