Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CUTCQ9NTM9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUTCQ9NTM9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUTCQ9NTM9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTCQ9NTM9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms