Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTG1Q9NSN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTG1Q9NSN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTG1Q9NSN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms