Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C19orf12Q9NSK7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C19orf12Q9NSK7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms