Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSG2

C1orf112, Uncharacterized protein C1orf112, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf112Q9NSG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1orf112Q9NSG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf112Q9NSG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C1orf112Q9NSG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf112Q9NSG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C1orf112Q9NSG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms