Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT84Q9NSB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT84Q9NSB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT84Q9NSB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT84Q9NSB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms