Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAR1AQ9NR31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAR1AQ9NR31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAR1AQ9NR31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAR1AQ9NR31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms