Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM6Q9NQX0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM6Q9NQX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRDM6Q9NQX0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM6Q9NQX0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM6Q9NQX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms