Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNB1IP1Q9NPC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms