Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ap3b2Q9JME5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b2Q9JME5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ap3b2Q9JME5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap3b2Q9JME5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b2Q9JME5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b2Q9JME5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ap3b2Q9JME5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ap3b2Q9JME5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b2Q9JME5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms