Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrfQ9JM73 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrfQ9JM73 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrfQ9JM73 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrfQ9JM73 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SrfQ9JM73 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms