Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col5a3Q9JLI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col5a3Q9JLI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col5a3Q9JLI2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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