Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm1Q9JLF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgm1Q9JLF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgm1Q9JLF6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm1Q9JLF6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm1Q9JLF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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