Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx5Q9JKQ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx5Q9JKQ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx5Q9JKQ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx5Q9JKQ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx5Q9JKQ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx5Q9JKQ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms