Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AtrQ9JKK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AtrQ9JKK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AtrQ9JKK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AtrQ9JKK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms