Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcan3Q9JKK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rcan3Q9JKK0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rcan3Q9JKK0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms