Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl3Q9JKB1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl3Q9JKB1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl3Q9JKB1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl3Q9JKB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl3Q9JKB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl3Q9JKB1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl3Q9JKB1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uchl3Q9JKB1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uchl3Q9JKB1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl3Q9JKB1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms