Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RprmQ9JJ72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RprmQ9JJ72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms