Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MkksQ9JI70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MkksQ9JI70 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MkksQ9JI70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MkksQ9JI70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MkksQ9JI70 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms