Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549Q9HCM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms