Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN10Q9HC96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN10Q9HC96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN10Q9HC96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN10Q9HC96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN10Q9HC96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms