Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX1Q9HBU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARX1Q9HBU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX1Q9HBU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms