Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP29Q9HBJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP29Q9HBJ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP29Q9HBJ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms