Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTN4Q9HB63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTN4Q9HB63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTN4Q9HB63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTN4Q9HB63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms