Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF556Q9HAH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF556Q9HAH1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF556Q9HAH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms