Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUDS3Q9H7L9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUDS3Q9H7L9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SUDS3Q9H7L9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUDS3Q9H7L9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUDS3Q9H7L9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUDS3Q9H7L9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUDS3Q9H7L9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUDS3Q9H7L9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUDS3Q9H7L9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms