Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCX3BQ9H321 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCX3BQ9H321 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCX3BQ9H321 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms