Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRTNQ9H040 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRTNQ9H040 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPRTNQ9H040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms