Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP6Q9GZR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP6Q9GZR1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP6Q9GZR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SENP6Q9GZR1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms