Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tfip11Q9ERA6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tfip11Q9ERA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tfip11Q9ERA6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tfip11Q9ERA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tfip11Q9ERA6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tfip11Q9ERA6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms