Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1lQ9EQ00 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ropn1lQ9EQ00 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ropn1lQ9EQ00 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1lQ9EQ00 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms