Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pop7Q9DCH2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop7Q9DCH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pop7Q9DCH2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pop7Q9DCH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pop7Q9DCH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pop7Q9DCH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms